Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLR3EQ9NVU0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLR3EQ9NVU0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR3EQ9NVU0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR3EQ9NVU0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms