Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GPHNQ9NQX3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GPHNQ9NQX3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GPHNQ9NQX3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GPHNQ9NQX3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GPHNQ9NQX3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GPHNQ9NQX3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GPHNQ9NQX3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GPHNQ9NQX3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GPHNQ9NQX3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GPHNQ9NQX3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GPHNQ9NQX3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GPHNQ9NQX3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GPHNQ9NQX3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPHNQ9NQX3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GPHNQ9NQX3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GPHNQ9NQX3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPHNQ9NQX3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPHNQ9NQX3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPHNQ9NQX3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPHNQ9NQX3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GPHNQ9NQX3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GPHNQ9NQX3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GPHNQ9NQX3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GPHNQ9NQX3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms