Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4F12Q9HCS2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CYP4F12Q9HCS2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4F12Q9HCS2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4F12Q9HCS2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4F12Q9HCS2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4F12Q9HCS2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4F12Q9HCS2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4F12Q9HCS2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4F12Q9HCS2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4F12Q9HCS2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4F12Q9HCS2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP4F12Q9HCS2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP4F12Q9HCS2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP4F12Q9HCS2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP4F12Q9HCS2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP4F12Q9HCS2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP4F12Q9HCS2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP4F12Q9HCS2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYP4F12Q9HCS2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP4F12Q9HCS2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP4F12Q9HCS2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms