Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAH1

ZNF556, Zinc finger protein 556, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF556Q9HAH1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF556Q9HAH1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF556Q9HAH1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF556Q9HAH1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF556Q9HAH1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF556Q9HAH1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF556Q9HAH1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF556Q9HAH1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF556Q9HAH1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF556Q9HAH1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF556Q9HAH1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF556Q9HAH1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF556Q9HAH1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF556Q9HAH1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF556Q9HAH1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF556Q9HAH1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF556Q9HAH1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF556Q9HAH1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF556Q9HAH1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF556Q9HAH1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF556Q9HAH1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms