Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR55Q9H6Y2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
WDR55Q9H6Y2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR55Q9H6Y2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR55Q9H6Y2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
WDR55Q9H6Y2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR55Q9H6Y2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR55Q9H6Y2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR55Q9H6Y2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms