Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSS3Q9H6R3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACSS3Q9H6R3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSS3Q9H6R3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms