Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLSTN2Q9H4D0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLSTN2Q9H4D0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSTN2Q9H4D0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSTN2Q9H4D0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSTN2Q9H4D0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSTN2Q9H4D0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSTN2Q9H4D0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSTN2Q9H4D0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSTN2Q9H4D0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSTN2Q9H4D0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSTN2Q9H4D0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSTN2Q9H4D0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSTN2Q9H4D0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSTN2Q9H4D0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSTN2Q9H4D0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSTN2Q9H4D0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSTN2Q9H4D0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSTN2Q9H4D0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSTN2Q9H4D0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSTN2Q9H4D0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSTN2Q9H4D0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSTN2Q9H4D0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLSTN2Q9H4D0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLSTN2Q9H4D0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLSTN2Q9H4D0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLSTN2Q9H4D0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLSTN2Q9H4D0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CLSTN2Q9H4D0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLSTN2Q9H4D0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLSTN2Q9H4D0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLSTN2Q9H4D0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSTN2Q9H4D0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSTN2Q9H4D0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSTN2Q9H4D0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSTN2Q9H4D0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSTN2Q9H4D0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSTN2Q9H4D0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSTN2Q9H4D0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLSTN2Q9H4D0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSTN2Q9H4D0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSTN2Q9H4D0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSTN2Q9H4D0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLSTN2Q9H4D0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CLSTN2Q9H4D0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLSTN2Q9H4D0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLSTN2Q9H4D0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLSTN2Q9H4D0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSTN2Q9H4D0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSTN2Q9H4D0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSTN2Q9H4D0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.1 ms