Protein–RNA interactions for Protein: Q9H478

KCNQ1DN, KCNQ1 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1DNQ9H478 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNQ1DNQ9H478 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNQ1DNQ9H478 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNQ1DNQ9H478 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms