Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEMA6BQ9H3T3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SEMA6BQ9H3T3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA6BQ9H3T3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SEMA6BQ9H3T3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA6BQ9H3T3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA6BQ9H3T3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA6BQ9H3T3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEMA6BQ9H3T3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEMA6BQ9H3T3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA6BQ9H3T3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA6BQ9H3T3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA6BQ9H3T3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA6BQ9H3T3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA6BQ9H3T3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA6BQ9H3T3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA6BQ9H3T3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA6BQ9H3T3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA6BQ9H3T3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA6BQ9H3T3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEMA6BQ9H3T3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SEMA6BQ9H3T3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEMA6BQ9H3T3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEMA6BQ9H3T3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA6BQ9H3T3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms