Protein–RNA interactions for Protein: Q9H254

SPTBN4, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN4Q9H254 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTBN4Q9H254 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTBN4Q9H254 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms