Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC22A4Q9H015 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A4Q9H015 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A4Q9H015 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms