Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCOLN1Q9GZU1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCOLN1Q9GZU1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCOLN1Q9GZU1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCOLN1Q9GZU1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCOLN1Q9GZU1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCOLN1Q9GZU1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCOLN1Q9GZU1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCOLN1Q9GZU1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCOLN1Q9GZU1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCOLN1Q9GZU1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MCOLN1Q9GZU1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MCOLN1Q9GZU1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MCOLN1Q9GZU1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
MCOLN1Q9GZU1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCOLN1Q9GZU1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCOLN1Q9GZU1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCOLN1Q9GZU1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCOLN1Q9GZU1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MCOLN1Q9GZU1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MCOLN1Q9GZU1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MCOLN1Q9GZU1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCOLN1Q9GZU1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCOLN1Q9GZU1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCOLN1Q9GZU1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCOLN1Q9GZU1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCOLN1Q9GZU1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCOLN1Q9GZU1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCOLN1Q9GZU1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCOLN1Q9GZU1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCOLN1Q9GZU1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCOLN1Q9GZU1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCOLN1Q9GZU1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCOLN1Q9GZU1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCOLN1Q9GZU1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCOLN1Q9GZU1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCOLN1Q9GZU1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCOLN1Q9GZU1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCOLN1Q9GZU1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MCOLN1Q9GZU1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms