Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PDGFDQ9GZP0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PDGFDQ9GZP0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PDGFDQ9GZP0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PDGFDQ9GZP0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PDGFDQ9GZP0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
PDGFDQ9GZP0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PDGFDQ9GZP0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PDGFDQ9GZP0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PDGFDQ9GZP0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PDGFDQ9GZP0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PDGFDQ9GZP0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PDGFDQ9GZP0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
PDGFDQ9GZP0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PDGFDQ9GZP0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
PDGFDQ9GZP0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PDGFDQ9GZP0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PDGFDQ9GZP0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PDGFDQ9GZP0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PDGFDQ9GZP0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PDGFDQ9GZP0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PDGFDQ9GZP0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PDGFDQ9GZP0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PDGFDQ9GZP0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PDGFDQ9GZP0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PDGFDQ9GZP0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PDGFDQ9GZP0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms