Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LRRCC1Q9C099 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LRRCC1Q9C099 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
LRRCC1Q9C099 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRCC1Q9C099 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRCC1Q9C099 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LRRCC1Q9C099 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LRRCC1Q9C099 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LRRCC1Q9C099 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRCC1Q9C099 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRCC1Q9C099 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRCC1Q9C099 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRCC1Q9C099 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRCC1Q9C099 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRCC1Q9C099 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRCC1Q9C099 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRCC1Q9C099 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRCC1Q9C099 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LRRCC1Q9C099 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LRRCC1Q9C099 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LRRCC1Q9C099 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LRRCC1Q9C099 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRCC1Q9C099 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LRRCC1Q9C099 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LRRCC1Q9C099 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LRRCC1Q9C099 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LRRCC1Q9C099 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LRRCC1Q9C099 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LRRCC1Q9C099 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LRRCC1Q9C099 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LRRCC1Q9C099 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LRRCC1Q9C099 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
LRRCC1Q9C099 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
LRRCC1Q9C099 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LRRCC1Q9C099 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
LRRCC1Q9C099 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LRRCC1Q9C099 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LRRCC1Q9C099 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LRRCC1Q9C099 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LRRCC1Q9C099 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LRRCC1Q9C099 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LRRCC1Q9C099 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LRRCC1Q9C099 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LRRCC1Q9C099 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms