Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM109Q9BVC6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
TMEM109Q9BVC6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms