Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNPPD1Q9BV87 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNPPD1Q9BV87 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNPPD1Q9BV87 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms