Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT6

LRRC1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1Q9BTT6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC1Q9BTT6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC1Q9BTT6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC1Q9BTT6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC1Q9BTT6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC1Q9BTT6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC1Q9BTT6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC1Q9BTT6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC1Q9BTT6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC1Q9BTT6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC1Q9BTT6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC1Q9BTT6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC1Q9BTT6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC1Q9BTT6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC1Q9BTT6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC1Q9BTT6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC1Q9BTT6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC1Q9BTT6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC1Q9BTT6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC1Q9BTT6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC1Q9BTT6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC1Q9BTT6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC1Q9BTT6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC1Q9BTT6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC1Q9BTT6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC1Q9BTT6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC1Q9BTT6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC1Q9BTT6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC1Q9BTT6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC1Q9BTT6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC1Q9BTT6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC1Q9BTT6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC1Q9BTT6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
LRRC1Q9BTT6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC1Q9BTT6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms