Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCMBPQ9BTE3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCMBPQ9BTE3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCMBPQ9BTE3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCMBPQ9BTE3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCMBPQ9BTE3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCMBPQ9BTE3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MCMBPQ9BTE3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCMBPQ9BTE3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCMBPQ9BTE3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MCMBPQ9BTE3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCMBPQ9BTE3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCMBPQ9BTE3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCMBPQ9BTE3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCMBPQ9BTE3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCMBPQ9BTE3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCMBPQ9BTE3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCMBPQ9BTE3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCMBPQ9BTE3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCMBPQ9BTE3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCMBPQ9BTE3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCMBPQ9BTE3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCMBPQ9BTE3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCMBPQ9BTE3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCMBPQ9BTE3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCMBPQ9BTE3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.4 ms