Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZSWIM1Q9BR11 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ZSWIM1Q9BR11 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZSWIM1Q9BR11 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ZSWIM1Q9BR11 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZSWIM1Q9BR11 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms