Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOXF2Q9BQY4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOXF2Q9BQY4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RHOXF2Q9BQY4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOXF2Q9BQY4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms