Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCA3Q99758 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCA3Q99758 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCA3Q99758 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCA3Q99758 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCA3Q99758 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCA3Q99758 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCA3Q99758 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCA3Q99758 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCA3Q99758 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCA3Q99758 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ABCA3Q99758 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ABCA3Q99758 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ABCA3Q99758 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ABCA3Q99758 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCA3Q99758 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCA3Q99758 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCA3Q99758 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCA3Q99758 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCA3Q99758 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCA3Q99758 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCA3Q99758 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCA3Q99758 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCA3Q99758 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCA3Q99758 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCA3Q99758 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCA3Q99758 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCA3Q99758 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCA3Q99758 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCA3Q99758 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ABCA3Q99758 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ABCA3Q99758 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCA3Q99758 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCA3Q99758 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCA3Q99758 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCA3Q99758 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCA3Q99758 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCA3Q99758 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCA3Q99758 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCA3Q99758 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCA3Q99758 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCA3Q99758 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCA3Q99758 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
ABCA3Q99758 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCA3Q99758 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
ABCA3Q99758 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
ABCA3Q99758 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ABCA3Q99758 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ABCA3Q99758 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCA3Q99758 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCA3Q99758 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCA3Q99758 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCA3Q99758 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCA3Q99758 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCA3Q99758 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCA3Q99758 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCA3Q99758 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCA3Q99758 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCA3Q99758 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCA3Q99758 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCA3Q99758 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCA3Q99758 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCA3Q99758 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCA3Q99758 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCA3Q99758 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ABCA3Q99758 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms