Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LYSTQ99698 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYSTQ99698 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LYSTQ99698 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms