Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF3CQ99613 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF3CQ99613 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EIF3CQ99613 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EIF3CQ99613 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EIF3CQ99613 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EIF3CQ99613 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EIF3CQ99613 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EIF3CQ99613 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EIF3CQ99613 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EIF3CQ99613 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EIF3CQ99613 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF3CQ99613 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF3CQ99613 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF3CQ99613 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF3CQ99613 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF3CQ99613 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF3CQ99613 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF3CQ99613 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF3CQ99613 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF3CQ99613 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF3CQ99613 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF3CQ99613 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF3CQ99613 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF3CQ99613 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF3CQ99613 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF3CQ99613 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF3CQ99613 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF3CQ99613 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF3CQ99613 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF3CQ99613 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF3CQ99613 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF3CQ99613 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
EIF3CQ99613 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EIF3CQ99613 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EIF3CQ99613 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms