Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PNMA5Q96PV4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNMA5Q96PV4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA5Q96PV4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA5Q96PV4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PNMA5Q96PV4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PNMA5Q96PV4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNMA5Q96PV4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA5Q96PV4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA5Q96PV4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA5Q96PV4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA5Q96PV4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA5Q96PV4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA5Q96PV4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA5Q96PV4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA5Q96PV4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA5Q96PV4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA5Q96PV4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA5Q96PV4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA5Q96PV4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA5Q96PV4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA5Q96PV4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA5Q96PV4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms