Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OPALINQ96PE5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPALINQ96PE5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OPALINQ96PE5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OPALINQ96PE5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms