Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJA3Q96EY1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJA3Q96EY1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJA3Q96EY1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms