Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TLCD1Q96CP7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLCD1Q96CP7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLCD1Q96CP7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLCD1Q96CP7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLCD1Q96CP7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLCD1Q96CP7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLCD1Q96CP7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLCD1Q96CP7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLCD1Q96CP7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLCD1Q96CP7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLCD1Q96CP7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLCD1Q96CP7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLCD1Q96CP7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLCD1Q96CP7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLCD1Q96CP7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLCD1Q96CP7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLCD1Q96CP7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLCD1Q96CP7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLCD1Q96CP7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLCD1Q96CP7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLCD1Q96CP7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TLCD1Q96CP7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLCD1Q96CP7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms