Protein–RNA interactions for Protein: Q93100

PHKB, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKBQ93100 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHKBQ93100 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHKBQ93100 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHKBQ93100 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHKBQ93100 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHKBQ93100 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHKBQ93100 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHKBQ93100 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHKBQ93100 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHKBQ93100 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHKBQ93100 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PHKBQ93100 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHKBQ93100 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHKBQ93100 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHKBQ93100 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHKBQ93100 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHKBQ93100 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHKBQ93100 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHKBQ93100 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHKBQ93100 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PHKBQ93100 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms