Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCG3Q8WXD2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCG3Q8WXD2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCG3Q8WXD2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms