Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMO7Q8WWI1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.8■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.79■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.77■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.77■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
LMO7Q8WWI1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
LMO7Q8WWI1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
LMO7Q8WWI1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
LMO7Q8WWI1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LMO7Q8WWI1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LMO7Q8WWI1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LMO7Q8WWI1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LMO7Q8WWI1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
LMO7Q8WWI1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LMO7Q8WWI1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LMO7Q8WWI1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LMO7Q8WWI1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LMO7Q8WWI1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LMO7Q8WWI1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
LMO7Q8WWI1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
LMO7Q8WWI1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LMO7Q8WWI1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LMO7Q8WWI1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LMO7Q8WWI1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LMO7Q8WWI1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
LMO7Q8WWI1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LMO7Q8WWI1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LMO7Q8WWI1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LMO7Q8WWI1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms