Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWH5

TRUB1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB1Q8WWH5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRUB1Q8WWH5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRUB1Q8WWH5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms