Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY2

RFWD2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, humanhuman

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD2Q8NHY2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFWD2Q8NHY2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFWD2Q8NHY2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFWD2Q8NHY2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFWD2Q8NHY2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFWD2Q8NHY2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFWD2Q8NHY2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFWD2Q8NHY2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFWD2Q8NHY2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFWD2Q8NHY2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFWD2Q8NHY2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFWD2Q8NHY2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFWD2Q8NHY2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFWD2Q8NHY2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFWD2Q8NHY2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms