Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF248Q8NDW4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF248Q8NDW4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF248Q8NDW4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF248Q8NDW4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF248Q8NDW4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF248Q8NDW4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF248Q8NDW4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF248Q8NDW4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF248Q8NDW4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF248Q8NDW4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF248Q8NDW4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF248Q8NDW4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF248Q8NDW4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF248Q8NDW4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF248Q8NDW4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF248Q8NDW4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms