Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
LTBP4Q8N2S1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LTBP4Q8N2S1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
LTBP4Q8N2S1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LTBP4Q8N2S1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LTBP4Q8N2S1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LTBP4Q8N2S1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LTBP4Q8N2S1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
LTBP4Q8N2S1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
LTBP4Q8N2S1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
LTBP4Q8N2S1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
LTBP4Q8N2S1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
LTBP4Q8N2S1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36■■■■□ 3.35
LTBP4Q8N2S1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
LTBP4Q8N2S1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
LTBP4Q8N2S1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
LTBP4Q8N2S1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
LTBP4Q8N2S1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LTBP4Q8N2S1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LTBP4Q8N2S1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LTBP4Q8N2S1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
LTBP4Q8N2S1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
LTBP4Q8N2S1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
LTBP4Q8N2S1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
LTBP4Q8N2S1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
LTBP4Q8N2S1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
LTBP4Q8N2S1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
LTBP4Q8N2S1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
LTBP4Q8N2S1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
LTBP4Q8N2S1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
LTBP4Q8N2S1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
LTBP4Q8N2S1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
LTBP4Q8N2S1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
LTBP4Q8N2S1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
LTBP4Q8N2S1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
LTBP4Q8N2S1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
LTBP4Q8N2S1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
LTBP4Q8N2S1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
LTBP4Q8N2S1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
LTBP4Q8N2S1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
LTBP4Q8N2S1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
LTBP4Q8N2S1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
LTBP4Q8N2S1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
LTBP4Q8N2S1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
LTBP4Q8N2S1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
LTBP4Q8N2S1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.87■■■■□ 3.33
LTBP4Q8N2S1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
LTBP4Q8N2S1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
LTBP4Q8N2S1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
LTBP4Q8N2S1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
LTBP4Q8N2S1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
LTBP4Q8N2S1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
LTBP4Q8N2S1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
LTBP4Q8N2S1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
LTBP4Q8N2S1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
LTBP4Q8N2S1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
LTBP4Q8N2S1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
LTBP4Q8N2S1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
LTBP4Q8N2S1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
LTBP4Q8N2S1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
LTBP4Q8N2S1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
LTBP4Q8N2S1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
LTBP4Q8N2S1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
LTBP4Q8N2S1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
LTBP4Q8N2S1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
LTBP4Q8N2S1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
LTBP4Q8N2S1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LTBP4Q8N2S1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
LTBP4Q8N2S1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
LTBP4Q8N2S1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
LTBP4Q8N2S1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
LTBP4Q8N2S1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
LTBP4Q8N2S1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
LTBP4Q8N2S1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
LTBP4Q8N2S1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
LTBP4Q8N2S1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms