Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29P2Q8IUI4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX29P2Q8IUI4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNX29P2Q8IUI4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX29P2Q8IUI4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.8 ms