Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB43Q86YS6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB43Q86YS6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB43Q86YS6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB43Q86YS6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB43Q86YS6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB43Q86YS6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB43Q86YS6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB43Q86YS6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB43Q86YS6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB43Q86YS6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB43Q86YS6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB43Q86YS6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB43Q86YS6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB43Q86YS6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB43Q86YS6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB43Q86YS6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB43Q86YS6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB43Q86YS6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB43Q86YS6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB43Q86YS6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB43Q86YS6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB43Q86YS6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB43Q86YS6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB43Q86YS6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB43Q86YS6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB43Q86YS6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB43Q86YS6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB43Q86YS6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB43Q86YS6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB43Q86YS6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB43Q86YS6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB43Q86YS6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB43Q86YS6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB43Q86YS6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms