Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF554Q86TJ5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF554Q86TJ5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF554Q86TJ5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF554Q86TJ5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms