Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP01

RBM44, RNA-binding protein 44, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM44Q6ZP01 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM44Q6ZP01 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM44Q6ZP01 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM44Q6ZP01 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms