Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP1Q6WKZ4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB11FIP1Q6WKZ4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP1Q6WKZ4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP1Q6WKZ4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms