Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMCO3Q6UWJ1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMCO3Q6UWJ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
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