Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCSK4Q6UW60 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK4Q6UW60 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCSK4Q6UW60 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK4Q6UW60 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms