Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCE3

PGM2L1, Glucose 1,6-bisphosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM2L1Q6PCE3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGM2L1Q6PCE3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGM2L1Q6PCE3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGM2L1Q6PCE3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGM2L1Q6PCE3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGM2L1Q6PCE3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGM2L1Q6PCE3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGM2L1Q6PCE3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGM2L1Q6PCE3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PGM2L1Q6PCE3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGM2L1Q6PCE3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGM2L1Q6PCE3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGM2L1Q6PCE3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGM2L1Q6PCE3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGM2L1Q6PCE3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGM2L1Q6PCE3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGM2L1Q6PCE3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms