Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RALGAPA1Q6GYQ0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RALGAPA1Q6GYQ0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RALGAPA1Q6GYQ0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RALGAPA1Q6GYQ0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms