Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0I6

KDM4D, Lysine-specific demethylase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4DQ6B0I6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM4DQ6B0I6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4DQ6B0I6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM4DQ6B0I6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM4DQ6B0I6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM4DQ6B0I6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM4DQ6B0I6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4DQ6B0I6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4DQ6B0I6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4DQ6B0I6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4DQ6B0I6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM4DQ6B0I6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4DQ6B0I6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4DQ6B0I6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4DQ6B0I6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM4DQ6B0I6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4DQ6B0I6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4DQ6B0I6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4DQ6B0I6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM4DQ6B0I6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms