Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CEP350Q5VT06 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CEP350Q5VT06 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CEP350Q5VT06 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CEP350Q5VT06 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CEP350Q5VT06 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CEP350Q5VT06 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CEP350Q5VT06 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CEP350Q5VT06 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CEP350Q5VT06 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CEP350Q5VT06 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CEP350Q5VT06 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CEP350Q5VT06 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CEP350Q5VT06 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CEP350Q5VT06 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CEP350Q5VT06 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CEP350Q5VT06 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CEP350Q5VT06 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP350Q5VT06 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CEP350Q5VT06 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CEP350Q5VT06 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.8 ms