Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LDLRAD1Q5T700 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LDLRAD1Q5T700 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LDLRAD1Q5T700 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LDLRAD1Q5T700 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LDLRAD1Q5T700 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LDLRAD1Q5T700 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LDLRAD1Q5T700 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LDLRAD1Q5T700 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LDLRAD1Q5T700 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LDLRAD1Q5T700 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LDLRAD1Q5T700 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LDLRAD1Q5T700 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LDLRAD1Q5T700 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LDLRAD1Q5T700 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms