Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LACTB2Q53H82 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LACTB2Q53H82 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LACTB2Q53H82 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LACTB2Q53H82 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.9 ms