Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSD17B12Q53GQ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HSD17B12Q53GQ0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.3 ms