Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PHLDA2Q53GA4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PHLDA2Q53GA4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PHLDA2Q53GA4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PHLDA2Q53GA4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PHLDA2Q53GA4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHLDA2Q53GA4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHLDA2Q53GA4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms