Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI67

KRTAP6-3, Keratin-associated protein 6-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP6-3Q3LI67 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP6-3Q3LI67 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP6-3Q3LI67 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP6-3Q3LI67 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms